El origen de los wikis esta en la comunidad de patrones de diseño, cuyos integrantes los utilizaron para escribir patrones de programación. El Primer WikiWikiWeb creado por Ward cunningham, quien invento y dio nombre al concepto wiki, y produjo la primera implementación de un servidor WikWiki para el repositorio de patrones del portland en 1995. En palabras del propio Cunningham, un wiki es la base de datos en linea mas simple que pueda funcionar. El wiki de Ward aun es uno de los sitios wiki mas populares.
En enero de 2001, los fundadores del proyecto de enciclopedia Nupedia, Jumbo Wales y Larry Sanger, decidieron utilizar un wiki como base para el proyecto de enciclopedia wikipedia originalmente se uso el software UseMod, pero luego crearon un software propio, MediawIKI, que ha sido adoptado después por muchos otros wikis.
El wiki mas grande que existe es la versión en inglez de Wikipedia, seguida por varias otras versiones del proyecto. Los wikis ajenos a Wikipedia son muchos mas pequeños y con menor participación de usuarios, generalmente debido al hecho de ser mucho mas especializados. Es muy frecuente, por ejemplo, la creación de wikis para proveer de documentación a programas informáticos, especialmente los desarrollados en softwaew libre.
